孢子自動捕捉系統是現在孢子信息監測的一款設備，真菌病發生后，除一些常見癥狀外，通常還有其特定的疾病，即病原體在病組織中的特殊表現。如黑色小顆粒、輪狀霉層、絮狀物等。例如，小麥黑穗病和玉米黑粉病都出現在耳朵上，即病原菌的孢子。

孢子危害有很多，比如陜北油松林的松針銹病，是一種借助孢子傳播氣流的疾病，遇到油松松針后，會形成芽管，從氣孔侵入。這時，菌絲體會在松針中過冬，第二年5月形成銹孢子器，感染后形成冬孢子堆。如果油松患有松針銹病，樹冠下部的松針會減少或減輕重量。

孢子自動捕捉系統是通過高倍光學顯微成像技術對孢子進行拍攝，然后上傳到云平臺，用戶就可以對區域內的孢子進行遠程監測，極大地減輕了人力損失。

孢子自動捕捉系統的應用是現在農業發展的體現，隨著科技的發展，提高農業現在化水平是農業發展的重點，該設備具有遠程實時查看和控制、實時分析孢子的功能，是現在自動捕捉分析孢子信息的重要設備。